阿里山高山博物館建於1935年10月,為「始政40周年紀念台灣博覽會」地方館之一,博覽會主場在台北市,同時間,全台各大城市都設有地方主題館,阿里山高山博物館即屬於「嘉義特設館」第二會場(第一會場在嘉義市兒童樂園內),外觀為山莊式,內部為洋式木造平家建,占地48坪餘。
館內的展示主題為:新高山(玉山)阿里山自然生態、阿里山原住民鄒族與吳鳳、阿里山林業開發沿革。自然生態區包括植物(以草本臘葉為主)、鳥類、動物、昆蟲(以蝶類為主)、礦物等標本與氣象圖表。原住民區包括鄒族的服飾、家屋、生活器具,以及被神化為「教化」樣本的吳鳳事跡與吳鳳廟模型。阿里山林業開發區包括伐木用具、集材狀況與樹幹標本等。


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